Členové laboratoře

Karel Müller (muller@ueb.cas.cz)

Tomáš Moravec (moravec@ueb.cas.cz)

Alena Trávníčková

Jitka Svobodová

Náplň laboratoře

TRANSKRIPTOMIKA

• Asistence s návrhem experimentu
• Izolace RNA s následnou kontrolou kvality
• Zajištění RNA-seq služby
• Bioinformatické zpracování dat (kvantifikace transkriptů, kontrola kvality analýzy, základní statistické zpracování)
• Asistence s interpretací výsledků a navržení následných experimentů (validace výsledků pomocí RT-qPCR, návrh funkčních experimentů)

SYNTETICKÁ BIOLOGIE

• Asistence s návrhem experimentu a design vhodného konstruktu
• Příprava konstruktů (využíváme zejména GoldenBraid-kompatibilní postupy)
• Správa a uchování dílčích konstruktů a patřičné databáze

Příklady funkce konstruktů:

• UP/DOWN regulace vybraného genu
• CRISPR-Cas9 cílená mutageneze
• Příprava rekombinantních proteinů
• Exprese fúzních proteinů (široký výběr nejen fluorescenčních tagů)
• Exprese proteinů regulovaná přirozenými promotory a terminátory
• Transientní exprese
• Chemicky regulovaná exprese
• Virus-induced gene silencing (zejména pomocí ALSV a TRV systému), široký výběr cílových rostlin

V případě zájmu ukážeme, naučíme a pomůžeme ve vašich vlastních aplikacích.

Jsme úzce propojeni s Mikroskopické pracoviště ÚEB AV ČR.

Ceník klonování